为进一步加强农业专项资金的使用和管理，确保农业专项资金安全、规范、高效运行，文山州农业局在组织局属各单位自查自纠的基础上，抽调部分财会业务精干人员组成三个检查小组，于2017年7月4日－7日分别对州农科院、农经站、渔业站、动物卫生监督所、种子管理站、农技推广中心、经作站、州农校共8个单位,截止2017年6月底存量项目资金使用、管理及设立“小金库”情况进行排查。

这次检查的主要内容是：项目资金的使用、管理情况；是否存在用资产处置、出租收入、以各种名义套取资金、以假发票等非法票据骗取资金设立“小金库”的情况。

检查组采取查阅会计凭证、会计报表，进行职工走访、了解情况等方式，对8个单位进行全面检查。经过检查，未发现套取、骗取和转移项目资金、私设“小金库”等情况。但在项目资金使用、管理、财务报销、账务处理等方面还存在一些问题：一是扩大支出范围；二是票据使用、差旅费报销不规范；三是原始凭证不齐全、部分单据签字手续不完善；四是项目资金未分项核算；五是项目资金执行进度慢等。

根据检查中发现的问题，7月24日，局党委及时召开检查情况通报会，对各单位存在的问题进行通报并限期进行整改，要求各单位严格执行《会计法》《会计基础工作规范》《云南省财政支农专项资金管理暂行办法》《行政事业单位内部控制制度》以及中央和省州有关专项资金管理办法等法律法规，确保各项资金专款专用、安全运行。